دفتر آموزش مداوم انستیتو  آموزشی، تحقیقاتی و درمانی قلب و عروق شهید رجایی با هدف به روز کردن دانش پزشکی و به منظور آشنایی با تازه های علمی و عملی حرفه مربوطه و انطباق آن با نیازهای جامعه، افزایش آگاهی عملی ، مهارت های حرفه ای و ارتباطی ، دانش فنی و اخلاق پزشکی و یا اصلاح نگرش دانش آموختگان رشته های علوم پزشکی، افزایش کیفی خدمات بهداشتی ، درمانی و آموزشی، آشنا کردن جامعه پزشکی هدف با سیاست ها ، جهت گیری ها و اولویت ها ی بهداشتی ، درمانی کشور فعالیت می نماید و جلب مشارکت جامعه پزشکی ، برنامه ریزی  و اجرای آموزش  های حضوری و غیرحضوری و ترغیب مشمولین قانون آموزش مداوم به فعالیت های پژوهشی ، تالیف ، ترجمه ، مقاله نویسی را جزء وظایف خود می داند.

در گام دوم از اهداف این مجموعه می توان به تقویت و تحکیم آموخته های قبلی، نظارت برحسن اجرای برنامه ها و ارتقاء کیفی آن ها ، تهیه دستورهای اجرایی مناسب در راستای رسالت آموزش مداوم، اولویت بندی اجرای برنامه های مرکز بر اساس نیازسنجی انجام شده، در دسترس قرار دادن فیلم ها و اسلاید های مربوط به برنامه های وبیناری ، غیر حضوری و حضوری برای مشمولان و گروه هدف از طریق فضای وبسایت انستیتو، تقویت مرکز آموزش مهارتی و حرفه ای در انستیتو و در نهایت تحقق استانداردهای اعتباربخشی آموزش مداوم اشاره نمود.